José Reis é Professor Catedrático da Faculdade de Economia da Universidade de Coimbra (FEUC) e Investigador do Centro de Estudos Sociais (CES).

Os seus temas de investigação em economia compreendem três áreas principais: Economia dos Territórios, Institucionalismo, Estado e Governação e Economia Portuguesa. Os trabalhos publicados estão disponíveis em livros e em revistas, destacando-se entre estas a Revista Crítica de Ciências Sociais (da qual foi membro do Conselho de Redacção) e Notas Económicas – Revista da Faculdade de Economia da Universidade de Coimbra (de que foi fundador e Director).

Actualmente é coordenador do Programa de Doutoramento em Governação, Conhecimento e Inovação (CES e FEUC).

Do seu Curriculum Vitae faz parte ter sido Secretário de Estado do Ensino Superior (1999-2001), Presidente da Comissão de Coordenação da Região Centro (1996-1999), Presidente do Conselho Científico da FEUC (1992-1994 e 2002-2004) e candidato a Reitor da Universidade de Coimbra (2003) com o programa Um Outro Futuro para a Universidade de Coimbra.
Publica regularmente uma coluna de opinião no Diário Económico, como membro do Painel I&D – Investigações & Debates, para além de noutros jornais. Alguns desses artigos, assim como algumas intervenções públicas, são especificamente sobre Coimbra e o seu desenvolvimento urbano.